承啟生物承接國(guó)際人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃官方數(shù)據(jù)庫建設(shè)

深圳2021年12月3日 /美通社/ -- 近日，國(guó)際人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃確定，由承啟生物承接國(guó)際人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃的官方數(shù)據(jù)庫neXtProt（亞洲分站）的建設(shè)。這是國(guó)際人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃第一次將官方數(shù)據(jù)庫交由亞洲公司進(jìn)行建設(shè)，標(biāo)志著中國(guó)在人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃中的核心地位提升，也顯示出承啟生物不僅僅在測(cè)序領(lǐng)域取得國(guó)際聲譽(yù)，同時(shí)在蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域也受到國(guó)際學(xué)術(shù)界的權(quán)威認(rèn)可。11月底，承啟與neXtProt數(shù)據(jù)庫工作人員進(jìn)行視頻連線會(huì)議，neXtProt亞洲分站的建設(shè)正式開始。

承啟團(tuán)隊(duì)與neXtProt工作人員視頻連線會(huì)議

國(guó)際人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃（Human Proteome Project, HPP）是國(guó)際人類基因組計(jì)劃（Human Genome Project, HGP）的后續(xù)國(guó)際合作項(xiàng)目，最早可追溯至2000年。彼時(shí)，人類基因組計(jì)劃尚未完成，科學(xué)家們就已經(jīng)意識(shí)到搞清楚人類基因組并不能完全理解人的生理病理過程，因?yàn)橐粋€(gè)基因可以變化出幾種至數(shù)千種不同的蛋白質(zhì)形體(proteoform)，而蛋白質(zhì)才是各種生理和病理功能的實(shí)際執(zhí)行者。因此，各國(guó)科學(xué)家又策劃了人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃，力圖研究所有的人類蛋白質(zhì)，這樣才能解開生命的奧秘。經(jīng)過12年的前期準(zhǔn)備，2012年人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃正式啟動(dòng)。

人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃的官方數(shù)據(jù)庫是neXtProt (www.nextprot.org)，目的是建立一個(gè)人類蛋白質(zhì)的百科全書。這個(gè)龐大的數(shù)據(jù)庫最初由瑞典的瑞士生物信息學(xué)研究所(Swiss Institute of Bioinformatics) 和GeneBio SA 共同開發(fā)，不但存儲(chǔ)了大量的人類蛋白質(zhì)知識(shí)庫，也有大量蛋白質(zhì)組、微陣列、RNA、蛋白質(zhì)相互作用、蛋白質(zhì)-小分子相互作用等高質(zhì)量數(shù)據(jù)集，其上的數(shù)據(jù)頻繁地更新，是人類蛋白質(zhì)研究的集大成者，相當(dāng)于研究人類蛋白質(zhì)的基礎(chǔ)設(shè)施。

neXtProt數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站界面

隨著人類蛋白質(zhì)研究的不斷深入，neXtProt數(shù)據(jù)庫的容量越來越大，服務(wù)器負(fù)荷日漸沉重。中國(guó)日益增長(zhǎng)的科研實(shí)力使得中國(guó)學(xué)者訪問該數(shù)據(jù)庫的需求與日俱增，但現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫的資源卻遠(yuǎn)遠(yuǎn)不能滿足要求。雪上加霜的是，因?yàn)橐咔楹徒?jīng)濟(jì)原因，瑞士政府削減了對(duì)這一生物信息基礎(chǔ)設(shè)施的投資，使neXtProt數(shù)據(jù)庫無力進(jìn)行擴(kuò)容。為了推動(dòng)人類科學(xué)界對(duì)人類蛋白質(zhì)組的研究，尋找有實(shí)力、有口碑的單位進(jìn)行合作就成為其最佳選擇。最終，承啟被選定為neXtProt亞洲分站的承建單位。

雖然承啟的主營(yíng)業(yè)務(wù)主要是與大規(guī)模測(cè)序相關(guān)，由于其自研的FANSe系列高精度測(cè)序比對(duì)算法而被業(yè)界熟知，但承啟在蛋白質(zhì)組上的積累很早就開始了。早在2014年，承啟首席科學(xué)家張弓教授所建立的翻譯組測(cè)序技術(shù)就被作為人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃的核心支柱之一，并連續(xù)被HUPO（人類蛋白質(zhì)組組織）邀請(qǐng)?jiān)贖UPO大會(huì)上做演講。2017年，承啟在HUPO大會(huì)上宣布免費(fèi)為人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃提供翻譯組測(cè)序服務(wù)。2018年，承啟發(fā)布了當(dāng)時(shí)世界上最強(qiáng)的翻譯組學(xué)數(shù)據(jù)庫，為蛋白質(zhì)組研究提供了重要的參考，該數(shù)據(jù)庫被發(fā)表在國(guó)際權(quán)威期刊Nucleic Acids Research上。2019年，張弓教授發(fā)表重大成果，通過翻譯組測(cè)序技術(shù)發(fā)現(xiàn)了數(shù)千個(gè)原本認(rèn)為不可能編碼蛋白質(zhì)的“非編碼基因”實(shí)際上能翻譯出50個(gè)氨基酸以上的蛋白質(zhì)，并且這些蛋白質(zhì)穩(wěn)定存在，在癌癥中發(fā)揮著重要作用，人類基因組需要被系統(tǒng)性地重新注釋。承啟在這一研究中提供了核心的生物信息學(xué)分析服務(wù)。因此承啟被委以此重任，絕非偶然。

對(duì)承啟而言，常年具備處理海量組學(xué)數(shù)據(jù)的能力，可以完全承擔(dān)建立neXtProt所需的服務(wù)器資源和技術(shù)資源，因此neXtProt亞洲分站的建設(shè)和運(yùn)維都將由承啟負(fù)責(zé)。

承啟承建人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃官方數(shù)據(jù)庫neXtProt的亞洲分站，標(biāo)志著中國(guó)在人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃中的核心地位提升，這是承啟為推動(dòng)人類蛋白質(zhì)組計(jì)劃進(jìn)展、為中國(guó)和亞洲的蛋白質(zhì)科學(xué)發(fā)展的又一貢獻(xiàn)。

相關(guān)鏈接 :

http://www.chi-biomedicine.com