可以用AVR Studio的4.0或更高版本控制STK500和JTAGICE，選擇STK500 or AVRISP和Auto或者具體的COM?端口進行聯(lián)機，點擊avr studio主窗口中的圖標前面標有Con的那個圖標，然后按下圖選擇即可進行JTAG的聯(lián)機，由于avr studio會記憶用戶使用的設備是并且同時會記憶用戶使用的COM號，如果下次和上次使用的是相同的設備并且沒有更換COM口，那么下次使用的時候直接點擊右邊標有AVR的那個圖標就可以快速進入聯(lián)機狀態(tài)；如果下次和上次使用了不同的設備或不同的COM口請使用Con圖標進行聯(lián)機。
JTAG和目標板相連
AVR JTAG 同目標板的連接：最小需要6條線與目標板相連，才可以完成仿真任務，他們是：TCK 、TMS 、TDO 、TDI、Vref、GND,另外有兩條可選擇的引線nSRST 和Vsupply 。引腳nTRST不接，Vsupply的功能是由目標板向JTAGICE供電（僅對接口部分）nSRST的作用是監(jiān)視目標板的復位線。然而，在仿真過程中不是必須的。如果應用程序對MCUSR中JTD位進行了編程，JTAG接口就會關閉，為了使用JTAGICE對目標板重新編程。就必須控制復位引腳。
連接JTAG ICE仿真器：聯(lián)機之前請確保本設備已經(jīng)和目標板有連接且LED4點亮。
進行JTAG ICE聯(lián)機時請確保目標AVR選中如下熔絲項：如下圖
程序下載和融絲位設置
打開AVRStudio，將會提示一個welcome對話框，如下圖所示：
點CANcel鍵取消（建議你把左邊的show this dialog on也去掉）。
然后選擇下載工具：
稍等片刻就進入AVR JTAG的工作窗口：
Program頁面可以燒寫flash或者內(nèi)部EEPROM，不要忘記先選擇目標板的芯片類型device。而Fuses頁面可以設置融絲位：
LOCkBits是IAP設置，Advanced設置芯片標識、通訊端口等，Auto是JTAG通訊一開始時的動作，這幾個不常用的請參考工具說明使用。
Board里可以取得當前的目標板供電電壓，其實也就是JTAG引腳的管腳4上的電壓：
進入仿真界面
對于以前已經(jīng)仿真調(diào)試過的程序，可以使用Project->Recent Progects來選擇要打開的工程。
對于剛生成還從未仿真過的用戶程序，則使用File->Open File…來打開工程所生成的cof文件。注意編譯環(huán)境也需要設置生成目標文件為cof文件。這個文件包含調(diào)試信息，可以在C源程序的環(huán)境下調(diào)試，如果打開的是hex，則只能在編譯器生成的匯編語言下調(diào)試了。文件打開后就是調(diào)試工具和目標芯片選擇：
其中，JTAG ICE就是通過AVR JTAG仿真器硬仿真目標系統(tǒng)，而AVR Simulator則是軟仿真，只能仿真芯片和系統(tǒng)外圍無關。在這里，我們當然選擇JTAG ICE，然后就看到右面所能支持的Device列表：
黑色表示可選，灰色不可選?？蛇x的設備也就是具有JTAG接口的AVR芯片。調(diào)試工具和目標芯片都選好后，點Finish就進入仿真調(diào)試界面。
仿真調(diào)試過程
和別的仿真軟件一樣，AVRStudio具有單步、全速、跟蹤函數(shù)、查看變量、查看芯片內(nèi)部寄存器、匯編跟蹤等功能，祥見Debug菜單。需要注意的是硬件仿真過程中最多只能設置三個斷點（這個與JTAG鏈的硬件協(xié)議有關，感興趣的可以參考JTAG協(xié)議文件）。
注意點
a、使用程序下載和融絲位設置，必須在非仿真調(diào)試環(huán)境下。
b、調(diào)試Boot區(qū)程序必須先編程BootRST位，而調(diào)試用戶區(qū)程序則必須保證BootRST位沒有被編程（默認）。
固件升級
當你安裝一個新版本的AVRStudio后，可能AVR JTAG USB仿真器就需要固件升級后才能正常使用了。這種情況下的提示如下：
此時點確定，稍候將會彈出avrprog窗口：
注意如果提示失敗，請斷開仿真器與目標板的連接，斷開仿真器與電腦的連接，然后重新按照仿真器連接、目標板連接的順序得到固件升級提示。
出現(xiàn)avrprog窗口后，點擊Browse進入升級文件選擇，把文件目錄定位到你所安裝AVRStudio的目錄下的JTAGICE目錄，如下圖所示：
選擇文件類型為所有文件，然后選擇文件Upgrade.ebn，打開。
點Flash里面的Program開始燒寫。如果中途燒寫失敗，請檢查USB連接線的可靠性，并重新連接進行升級。
燒寫結束后將會彈出一個窗口提示完成：
點擊確定，然后退出avrprog窗口。
最后把仿真器與目標板、電腦斷開連接，再重新進行連接，就完成了仿真器的固件升級。之后的使用和以前一樣。
注意：一般情況下，完成固件升級后就不能在當前版本之前的軟件版本中使用了。
關于在AVR studio中詳細使用STK500和JTAG ICE請參考 馬潮老師翻譯的avr studio中文幫助
JTAG常見故障現(xiàn)象：如下圖，表示JTAG本身是好的，只是無法和目標AVR聯(lián)機，請檢查目標AVR芯片和JTAG接線是否正確？JTAG溶絲使能設置好沒有？JTAG電纜可能有斷線更換一條再試 。
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