每秒20億億次性能 美國(guó)啟用TOP500最強(qiáng)超算尋求新冠病毒藥物
COVID-19新冠病毒目前還沒有特效藥,全球都在加緊研發(fā)對(duì)應(yīng)的藥物及疫苗。為了加快藥物研發(fā),美國(guó)啟用了目前全球最強(qiáng)的超算Summit,每秒浮點(diǎn)性能可達(dá)20億億次。
Summit超算位于美國(guó)橡樹嶺國(guó)家實(shí)驗(yàn)室,2017年底落成,從2018年上半年開始一直位列TOP500超算第一,終結(jié)了中國(guó)天河2號(hào)/太湖之光超算保持的10連冠,不出意外的話今年的2次TOP500冠軍還是它。
Summit超算使用了IBM Power 9處理器及NVIDIA的Tesla V100加速卡,每個(gè)節(jié)點(diǎn)2組22核Power 9處理器及6組Tesla V100加速卡,單節(jié)點(diǎn)性能42TFLOPS,峰值浮點(diǎn)性能200PFLOPS(20億億次),Linpack性能也有143PFLOPS。
在超算的應(yīng)用領(lǐng)域中,分子動(dòng)力學(xué)是最需要強(qiáng)大運(yùn)算性能的研究了,此前Summit超算也跑過老年癡呆、阿片類藥物成癮之類的運(yùn)算,這次研究人員用它來模擬新冠病毒與不同化合物的反應(yīng)。
據(jù)報(bào)道,這項(xiàng)研究已經(jīng)針對(duì)8000多種有可能跟病毒蛋白結(jié)合的物質(zhì)做了模擬測(cè)試,Summit超算篩選出77個(gè)可能有用的化合物,并根據(jù)測(cè)試結(jié)果做了排序。
不過超算的測(cè)試結(jié)果現(xiàn)在還只是參考,真正確定藥物是否有效還需要很復(fù)雜的過程。