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[導(dǎo)讀] (文章來源:人人都是產(chǎn)品經(jīng)理) 通常的圖像分類任務(wù)動輒幾十萬、上百萬,甚至上千萬的數(shù)據(jù)量相比,醫(yī)療影像它的數(shù)據(jù)量是非常少的。同時,由于設(shè)備參數(shù)、醫(yī)生的拍照手法或拍攝角度、光照的明暗不同,

(文章來源:人人都是產(chǎn)品經(jīng)理)

通常的圖像分類任務(wù)動輒幾十萬、上百萬,甚至上千萬的數(shù)據(jù)量相比,醫(yī)療影像它的數(shù)據(jù)量是非常少的。同時,由于設(shè)備參數(shù)、醫(yī)生的拍照手法或拍攝角度、光照的明暗不同,食管的表觀變化非常復(fù)雜。那么,我們怎樣才能在這樣的條件下得到一個可靠穩(wěn)定的模型?

采用Feature map。Feature Map是卷積核卷出來的,你用各種情況下的卷積核去乘以原圖,會得到各種各樣的feature map。你可以理解為你從多個角度去分析圖片。而不同的特征提取(核)會提取不同的feature,模型想要達(dá)成的目的是解一個最優(yōu)化,來找到能解釋現(xiàn)象的最佳的一組卷積核。

在同一層,我們希望得到對于一張圖片多種角度的描述,具體來講就是用多種不同的卷積核對圖像進(jìn)行卷,得到不同核(這里的核可以理解為描述)上的響應(yīng),作為圖像的特征。他們的聯(lián)系在于形成圖像在同一層次不同基上的描述。下層的核主要是一些簡單的邊緣檢測器(也可以理解為生理學(xué)上的simple cell)。

在拿到食管數(shù)據(jù)之后,如何判別這個食管屬于健康正常食管還是病變食管呢?當(dāng)我們判斷一個食管是否異常食管時,只需要找到一個病變區(qū)域,就能夠說明這個食管是異常的。但是反過來,在正常圖像中,并不能說找到一個正常特征,就說明這個食管是正常的。只能說在這張圖像中我們沒有找到異常特征,它可能是見正常的。

因此,在正常特征和異常特征之間,我們更傾向于提取病變特征,抑制正常特征。病變和正常的case都會經(jīng)過神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),以得到特征向量。對于這個向量,我們希望盡可能凸顯異常特征,讓正常特征趨近于0。我們是如何把這種信息建模到模型中的呢?我們對模型進(jìn)行了重新建模,最后準(zhǔn)確率大概在97%左右。前面的模型相對來說比較簡單,第三個模型主要是區(qū)分炎癥和癌癥,它與前兩個問題不大一樣。

一般情況下,病變的食管圖像里都會伴隨著一些炎癥的特征。我們對癌癥的判斷往往是通過一個紋理特別小的區(qū)域得出的,因此需要提取出更加精細(xì)化的特征。比較好的做法就是讓很多專家把病灶區(qū)非常嚴(yán)謹(jǐn)?shù)貥?biāo)注出來,這樣我們只需要對這個區(qū)域進(jìn)行識別就好了。這個標(biāo)注量非常大,因此數(shù)據(jù)異常匱乏。我們沒有癌癥區(qū)域的標(biāo)注數(shù)據(jù),但又希望得到非常精細(xì)化的特征,如何解決這個矛盾呢?

幸運(yùn)的是,我們雖然無法獲取到非常精準(zhǔn)的病變區(qū)域標(biāo)注影像,卻能夠相對容易地知道一張圖像是否包含癌癥,因為只需要跟病例對應(yīng)關(guān)聯(lián)起來就好了。這樣一來,我們可以更容易地得到圖像全局的標(biāo)簽。

如果一張圖像包含了癌癥,必然會有一個或幾個區(qū)域包含了癌癥的特征。也就是說,如果我們把圖像切分成幾個patch,必然會有某個或某幾個patch包含癌癥特征?;谶@樣一種思路,我們采取了多序列的學(xué)習(xí)方式。這個方法的內(nèi)在思想很簡單,就是把圖像切分成若干個patch,然后對每個patch建模,判別這個patch發(fā)生癌癥的概率。我們最后把所有patch里面癌癥概率最高的那塊,作為圖像是否包含癌癥的標(biāo)簽。

做的過程當(dāng)中,我們會逐漸積累精準(zhǔn)標(biāo)注的數(shù)據(jù),這些數(shù)據(jù)非常少,不足以虛擬一個模型。但圖像中的特征都是最精準(zhǔn)的,是經(jīng)過人為校驗和標(biāo)注的。我們怎樣才能把這種少量的、精準(zhǔn)的數(shù)據(jù)強(qiáng)化到癌癥識別中去呢?這是個非常有意思的問題,如果能解決這個問題,即使只有少量標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù),我們也能不斷提升。這里主要采用了多任務(wù)學(xué)習(xí)的方法,這個方法需要完成兩個任務(wù):

基于有病變區(qū)域標(biāo)注的數(shù)據(jù)建立有監(jiān)督的學(xué)習(xí)任務(wù);對于沒有病變區(qū)域標(biāo)注的數(shù)據(jù),建立前面提到的多序列學(xué)習(xí)任務(wù)。這兩個模型共享特征提取網(wǎng)絡(luò),特征提取網(wǎng)絡(luò)必須同時滿足兩大任務(wù),這樣才能把精準(zhǔn)標(biāo)注的特征強(qiáng)化到癌癥識別中去。

輔助診斷的目的是什么呢?我們希望機(jī)器最終能夠像臨床醫(yī)生一樣具備診斷疾病的能力。在介紹輔助診斷項目之前,我們先來看看一個醫(yī)生或者一個普通的學(xué)生是如何成長為一名專家的:一個學(xué)生從剛?cè)雽W(xué)開始,學(xué)習(xí)了大量專業(yè)課程,閱讀了大量專業(yè)醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)后,就可以積累一定程度的醫(yī)學(xué)知識。當(dāng)醫(yī)學(xué)知識達(dá)到一定程度之后,就可以去醫(yī)院里面實(shí)習(xí),由臨床醫(yī)生結(jié)合一些真實(shí)案例,指導(dǎo)他去學(xué)習(xí)診斷的技能。

醫(yī)學(xué)知識圖譜的構(gòu)建,也就是機(jī)器學(xué)習(xí)知識的過程;有了知識之后學(xué)習(xí)診斷的能力,也就是建立疾病判別的一些模型;讓機(jī)器在與專家的博弈過程中,不斷提升診斷水平,逐漸逼近甚至超過專家。醫(yī)療知識圖譜的構(gòu)建過程中,我們首先要對文本數(shù)據(jù)進(jìn)行處理。文本數(shù)據(jù)分成兩類,一類是半結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù),一類是非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)。

我們可以把病史分為幾個部分:疾病的情況、入院的治療經(jīng)過、入院的依據(jù)等;把病史分為這樣幾部分信息后,再對每一類信息進(jìn)行細(xì)化和提?。唤?jīng)過提取之后,非結(jié)構(gòu)化的文本就變成了計算機(jī)能夠理解的結(jié)構(gòu)化文本;我們會把這些信息轉(zhuǎn)化為醫(yī)學(xué)知識圖譜存在電腦里,于是計算機(jī)就把這個知識學(xué)會了。

診斷的過程是這樣的,首先把一段人類語言描述的病情轉(zhuǎn)化成計算機(jī)可以理解的結(jié)構(gòu)化知識。有了結(jié)構(gòu)化的知識以后,機(jī)器就能理解這個人的情況,把知識推送到疾病診斷模型當(dāng)中,模型將給出一個疾病列表,診斷模型的流程大致就是這樣。

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