基于高通量測(cè)序的治療反應(yīng)生物模擬預(yù)測(cè)和實(shí)際臨床反應(yīng)對(duì)比

來源：EEFOCUS

精密醫(yī)學(xué)領(lǐng)先機(jī)構(gòu)及腫瘤治療應(yīng)答指數(shù)檢測(cè)（TRI）技術(shù)的全球先鋒企業(yè) Cellworks 集團(tuán)宣布：美國血液學(xué)會(huì)（ASH）期刊《Blood Advances》刊登了 ?iCare 1臨床研究的結(jié)果。該研究采用Cellworks的基因組生物模擬平臺(tái)，預(yù)測(cè)急性髓系白血?。ˋML）和骨髓增生異常綜合征（MDS）患者的治療反應(yīng)。本前瞻性研究旨在通過對(duì)比治療反應(yīng)的生物模擬預(yù)測(cè)和實(shí)際臨床反應(yīng)，評(píng)估AML和MDS患者基因組學(xué)計(jì)算生物學(xué)建模的生物學(xué)和臨床預(yù)測(cè)價(jià)值。

iCare 1前瞻性研究結(jié)果顯示，急性髓系白血?。ˋML）和骨髓增生異常綜合征（MDS）患者對(duì)標(biāo)準(zhǔn)治療（Standard of Care，簡稱SOC）反應(yīng)率的預(yù)測(cè)準(zhǔn)確率為90%。本研究采用Cellworks獨(dú)特的基因組學(xué)計(jì)算生物學(xué)建模（CBM）技術(shù)，了解化療后復(fù)發(fā)的機(jī)制，并為參與本研究的復(fù)發(fā)患者提出新的再誘導(dǎo)治療方案。

佛羅里達(dá)大學(xué)醫(yī)學(xué)院教授Christopher R. Cogle博士表示：“高通量測(cè)序技術(shù)揭示了每位AML和MDS患者的大量基因組異常，以及患者之間的高度多樣性。作為臨床醫(yī)生，我們最大的挑戰(zhàn)就是分析解讀這樣龐大的基因組異常和基因組多樣性，從而為患者確定最佳的個(gè)性化治療方案。臨床時(shí)間的限制和每個(gè)病人疾病的復(fù)雜性要求我們使用諸如Cellworks的生物模擬等技術(shù)，為我們的病人提供最好的治療?！?/p>

Cellworks的計(jì)算生物學(xué)建模（CBM）及數(shù)字藥物生物模擬平臺(tái)依賴于MDS和AML患者個(gè)體的體細(xì)胞基因突變和基因拷貝數(shù)變異（CNV）。計(jì)算系統(tǒng)將基因組異常轉(zhuǎn)換成患者特異性蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)，用于生成虛擬疾病模型。然后，通過基于數(shù)學(xué)模型的生物模擬，使用藥物庫查詢患者特定的疾病模型，以預(yù)測(cè)包括抑制疾病細(xì)胞增殖和存活在內(nèi)的表型反應(yīng)。

這項(xiàng)前瞻性研究招募了120名AML和MDS患者，通過對(duì)比治療反應(yīng)的電腦預(yù)測(cè)和實(shí)際臨床結(jié)果，評(píng)估Cellworks計(jì)算生物學(xué)建模（CBM）技術(shù)預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性。在120名患者中，96名患者有完整的基因組檢測(cè)資料，50名患者的隨訪時(shí)長滿足評(píng)估要求。這50名患者接受了61種治療。Cellworks計(jì)算生物學(xué)建模（CBM）對(duì)iCare 1研究中32%復(fù)發(fā)樣本的標(biāo)測(cè)圖與患者復(fù)發(fā)情形下對(duì)治療無反應(yīng)的實(shí)際結(jié)果完全一致。此外，建模也確定了這些患者的化療耐藥機(jī)制。

“僅有高通量測(cè)序數(shù)據(jù)還不足以提供足夠的信息來提供個(gè)性化的腫瘤治療方案，”Cellworks首席執(zhí)行官Yatin Mundkur表示， “通過使用高通率測(cè)序數(shù)據(jù)完成生物模擬建模，我們能準(zhǔn)確預(yù)測(cè)個(gè)體患者的治療反應(yīng)，避免患者接受不必要的治療方案，從而避免毒副作用。通過提高治療選擇的準(zhǔn)確性，我們還可以降低醫(yī)療成本，幫助提高醫(yī)生的工作效率。"

通過運(yùn)用每位患者的基因組學(xué)數(shù)據(jù)獲得代表生物分子和生理學(xué)通路的基因組生物模擬軟件模型，Cellworks正在為個(gè)性化癌癥治療帶來重大改變。Cellworks個(gè)性化醫(yī)療預(yù)測(cè)通過提早采用成功的治療方法讓患者生活得到改觀，同時(shí)節(jié)省整個(gè)醫(yī)療體系的時(shí)間和成本。Cellworks還通過虛擬臨床試驗(yàn)、改進(jìn)的目標(biāo)識(shí)別、先導(dǎo)物驗(yàn)證以及重新確定藥品用途和使其重新發(fā)揮功用，為生物制藥行業(yè)帶來裨益。