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[導讀]安捷倫科技公司近日推出了它的用于分析基因組調(diào)控區(qū)域活動的CHIP-on-chip芯片平臺。真核生物的基因組DNA以染色質(zhì)的形式存在,因此,研究蛋白質(zhì)與DNA在染色質(zhì)環(huán)境下的相互作用是闡明真核生物基因表達機制的基本途徑。

安捷倫科技公司近日推出了它的用于分析基因組調(diào)控區(qū)域活動的CHIP-on-chip芯片平臺。真核生物的基因組DNA以染色質(zhì)的形式存在,因此,研究蛋白質(zhì)與DNA在染色質(zhì)環(huán)境下的相互作用是闡明真核生物基因表達機制的基本途徑。染色質(zhì)免疫沉淀技術(shù)(chromatin immunoprecipitation assay, CHIP)是目前唯一研究體內(nèi)DNA與蛋白質(zhì)相互作用的方法。它的基本原理是在活細胞狀態(tài)下固定蛋白質(zhì)-DNA復合物,并將其隨機切斷為一定長度范圍內(nèi)的染色質(zhì)小片段,然后通過免疫學方法沉淀此復合體,特異性地富集目的蛋白結(jié)合的DNA片段,通過對目的片斷的純化與檢測,從而獲得蛋白質(zhì)與DNA相互作用的信息。CHIP不僅可以檢測體內(nèi)反式因子與DNA的動態(tài)作用,還可以用來研究組蛋白的各種共價修飾與基因表達的關(guān)系。CHIP與其他方法的結(jié)合,可以擴大了其應用范圍,如CHIP與基因芯片相結(jié)合建立的CHIP-on-chip方法已廣泛用于順式作用因子的高通量篩選。這項技術(shù)對于大規(guī)模挖掘這類順式調(diào)控信息成績卓著。小鼠、大鼠等其他模式生物全基因組測序的完成,促進了人類基因組研究的進程。如今,比較基因組學(comparative genomics)策略不僅可用來精確的預測編碼基因,還可用于高通量尋找這部“天書”中大量的順式調(diào)控序列。同時它可以用于胚胎干細胞和一些疾病如癌癥、心血管疾病和中央神經(jīng)系統(tǒng)紊亂等發(fā)生的機制。研究人員還可以利用這項技術(shù)開發(fā)一些治療方法。
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