用于SciLifeLab提供醫(yī)療研究的微陣列技術(shù)
(文章來源:攜手健康網(wǎng))
總部位于蘇格蘭的微陣列儀器公司Arrayjet已獲得25萬英鎊的合同,向瑞典SciLifeLab(瑞典國家分子生物科學中心)提供微陣列技術(shù),以提供用于繪制人類蛋白質(zhì)圖譜的進一步分析信息。
SciLifeLab是瑞典的國家分子生物科學中心,由斯德哥爾摩和烏普薩拉的四所大學創(chuàng)建:斯德哥爾摩大學,卡羅林斯卡學院,KTH皇家理工學院和烏普薩拉大學。SciLifeLab將使用超級馬拉松賽來驗證對諸如蛋白質(zhì)之類的生物分子的分析,這些分子通過紅外成像在單芯片上暴露于數(shù)百種實驗條件下。
SciLifeLab的關(guān)鍵角色之一是通過提供最先進的儀器和科學專業(yè)知識來支持瑞典研究界。這是通過擁有近40個研究設(shè)施的十個基礎(chǔ)設(shè)施平臺,并由150多個研究小組和協(xié)作網(wǎng)絡(luò)(由多所瑞典大學主辦)支持的。
Arrayjet最初在九年前為KTH提供了微陣列儀器,該儀器已廣泛用于生產(chǎn)陣列,這些陣列已用于驗證HPA內(nèi)成千上萬種抗體以及用于自身免疫譜分析設(shè)施中的許多項目。隨著技術(shù)的進步以及對更高蛋白質(zhì)密度和更高樣品通量的需求,SciLifeLab上新安裝的Arrayjet Marathon提供了不僅顯著提高通量而且還提高了耐用性的方法。
由KTH托管的SciLifeLab自體免疫分析設(shè)備將使用Arrayjet儀器以及人類蛋白質(zhì)圖譜(Human Protein Atlas)產(chǎn)生的數(shù)千個蛋白質(zhì)片段,生成高密度蛋白質(zhì)微陣列,用于對生物流體中的自身抗體庫進行譜分析并驗證親和試劑。Arrayjet首席執(zhí)行官Iain McWilliam評論:SciLifeLab在人類蛋白質(zhì)組學的發(fā)展和復雜性方面正在突破我們的理解范圍,我很高興Arrayjet通過為研究人員提供通過儀器提供的手段來幫助增進這種理解。
SciLifeLab親和蛋白質(zhì)組學設(shè)施的強大親和試劑資源可追溯至人類蛋白質(zhì)圖譜。人類蛋白質(zhì)圖譜的創(chuàng)建始于2003年,其目標是利用各種技術(shù)的整合來繪制細胞,組織和器官中所有人類蛋白質(zhì)的圖譜,包括基于抗體的成像,轉(zhuǎn)錄組學,蛋白質(zhì)組學和系統(tǒng)生物學。
如今,該圖集由六個子圖集組成,它們繪制了17,000多種蛋白質(zhì)的位置及其在癌癥中的影響,在血液和大腦中的存在以及在代謝途徑中的背景信息。地圖集中的所有數(shù)據(jù)均作為開放獲取知識資源提供給學術(shù)界和工業(yè)界的科學家。
目前,陣列產(chǎn)生了42,000個不同的人類蛋白質(zhì)片段,這些片段代表18,000多個獨特的人類蛋白質(zhì)編碼基因,這使SciLifeLab能夠使用Arrayjet Super Marathon在大型芯片上對全蛋白質(zhì)組進行自身抗體反應(yīng)性的全蛋白篩選,從而能夠在高度受控的環(huán)境下進行更高效,更準確的打印條件。
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