PCIe?結(jié)構(gòu)和RAID如何在GPUDirect存儲中釋放全部潛能

隨著更快的圖形處理單元(GPU)能夠提供明顯更高的計(jì)算能力，存儲設(shè)備和GPU存儲器之間的數(shù)據(jù)路徑瓶頸已經(jīng)無法實(shí)現(xiàn)最佳應(yīng)用程序性能。NVIDIA的Magnum IO GPUDirect存儲解決方案通過在存儲設(shè)備和GPU存儲器之間實(shí)現(xiàn)直接路徑，可以極大地幫助解決該問題。然而，同等重要的是要使用容錯(cuò)系統(tǒng)來優(yōu)化其已經(jīng)非常出色的能力，從而確保在發(fā)生災(zāi)難性故障時(shí)備份關(guān)鍵數(shù)據(jù)。該解決方案通過PCIe^®結(jié)構(gòu)連接邏輯RAID卷，在PCIe 4.0規(guī)范下，這可以將數(shù)據(jù)速率提高到26 GB/s。為了解如何實(shí)現(xiàn)這些優(yōu)勢，首先需要檢查該解決方案的關(guān)鍵組件及其如何協(xié)同工作來提供結(jié)果。

Magnum IO GPUDirect存儲

Magnum IO GPUDirect存儲解決方案的關(guān)鍵優(yōu)勢是其能夠消除主要性能瓶頸之一，方法是不使用CPU中的系統(tǒng)存儲器將數(shù)據(jù)從存儲設(shè)備加載到GPU中進(jìn)行處理。通常將數(shù)據(jù)移動(dòng)到主機(jī)存儲器并傳送到GPU，這依賴于CPU系統(tǒng)存儲器中的回彈緩沖區(qū)，在數(shù)據(jù)傳送到GPU之前，會(huì)在其中創(chuàng)建數(shù)據(jù)的多個(gè)副本。但是，通過這種路徑移動(dòng)大量數(shù)據(jù)會(huì)產(chǎn)生延遲時(shí)間，降低GPU性能，并在主機(jī)中占用許多CPU周期。借助Magnum IO GPUDirect存儲解決方案，無需訪問CPU并避免了回彈緩沖區(qū)效率低下(圖1)。

圖1. Magnum IO GPUDirect存儲解決方案無需訪問CPU，避免了從數(shù)據(jù)路徑回彈緩沖

性能直接隨著傳送數(shù)據(jù)量的增加而提高，傳送數(shù)據(jù)量則隨著人工智能(AI)、機(jī)器學(xué)習(xí)(ML)、深度學(xué)習(xí)(DL)和其他數(shù)據(jù)密集型應(yīng)用所需的大型分布式數(shù)據(jù)集呈指數(shù)級增長。當(dāng)數(shù)據(jù)在本地存儲或遠(yuǎn)程存儲時(shí)，可以實(shí)現(xiàn)這些優(yōu)勢，從而允許以比CPU存儲器中的頁面緩存更快的速度訪問數(shù)拍字節(jié)的遠(yuǎn)程存儲。

優(yōu)化RAID性能

該解決方案中的下一個(gè)元素是包括RAID功能，用于保持?jǐn)?shù)據(jù)冗余和容錯(cuò)能力。雖然軟件RAID可以提供數(shù)據(jù)冗余，但底層軟件RAID引擎仍然使用精簡指令集計(jì)算機(jī)(RISC)架構(gòu)進(jìn)行操作，例如奇偶校驗(yàn)計(jì)算。當(dāng)比較高級RAID級別(例如RAID 5和RAID 6)的寫I/O延遲時(shí)間時(shí)，硬件RAID仍然比軟件RAID快得多，因?yàn)樘峁┝藢Ｓ锰幚砥鱽韴?zhí)行這些操作和回寫高速緩存。在流傳輸應(yīng)用中，軟件RIAD的長期RIAD響應(yīng)時(shí)間會(huì)導(dǎo)致數(shù)據(jù)堆積在高速緩存中。硬件RAID解決方案不存在緩存數(shù)據(jù)堆積問題，并且具有專門的備用電池，可以防止出現(xiàn)災(zāi)難性系統(tǒng)掉電時(shí)數(shù)據(jù)丟失的情況。

標(biāo)準(zhǔn)硬件RAID雖然減輕了主機(jī)的奇偶校驗(yàn)管理負(fù)擔(dān)，但大量數(shù)據(jù)仍需經(jīng)過RAID控制器才能發(fā)送到NVMe®驅(qū)動(dòng)器，導(dǎo)致數(shù)據(jù)路徑更加復(fù)雜。針對此問題的解決方案是NVMe優(yōu)化的硬件RAID，該解決方案提供了簡化的數(shù)據(jù)路徑，無需經(jīng)過固件或RAID片上控制器即可傳送數(shù)據(jù)。它還允許維護(hù)基于硬件的保護(hù)和加密服務(wù)。

混合PCIe結(jié)構(gòu)

PCIe Gen 4現(xiàn)在是存儲子系統(tǒng)內(nèi)的基本系統(tǒng)互連接口，但標(biāo)準(zhǔn)PCIe交換網(wǎng)具有與前幾代相同的基于樹的基本層級。這意味著，主機(jī)間通信需要非透明橋接(NTB)來實(shí)現(xiàn)跨分區(qū)通信，這使其變得復(fù)雜，特別是在多主機(jī)多交換網(wǎng)配置中。Microchip的PAX PCIe高級結(jié)構(gòu)交換網(wǎng)等解決方案能夠克服這些限制，因?yàn)樗鼈冎С秩哂嗦窂胶脱h(huán)，而這是使用傳統(tǒng)PCIe無法實(shí)現(xiàn)的。

結(jié)構(gòu)交換網(wǎng)具有兩個(gè)獨(dú)立的域，主機(jī)虛擬域(專用于每個(gè)物理主機(jī))和結(jié)構(gòu)域(包含所有端點(diǎn)和結(jié)構(gòu)鏈路)。來自主機(jī)域的事務(wù)會(huì)在結(jié)構(gòu)域中轉(zhuǎn)換為ID和地址，反之，結(jié)構(gòu)域中通信的非分層路由也是如此。這樣，系統(tǒng)中的所有主機(jī)便可共享連接到交換網(wǎng)和端點(diǎn)的結(jié)構(gòu)鏈路。

在嵌入式CPU上運(yùn)行的結(jié)構(gòu)固件通過可配置的下行端口數(shù)虛擬化符合PCIe標(biāo)準(zhǔn)的交換網(wǎng)。因此，交換網(wǎng)將始終顯示為具有直連端點(diǎn)的標(biāo)準(zhǔn)單層PCIe設(shè)備，而與這些端點(diǎn)在結(jié)構(gòu)中的位置無關(guān)。由于結(jié)構(gòu)交換網(wǎng)會(huì)攔截來自主機(jī)的所有配置平面通信(包括PCIe枚舉過程)并選擇最佳路徑，因此它可以實(shí)現(xiàn)這一點(diǎn)。這樣，GPU等端點(diǎn)便可綁定到域中的任何主機(jī)(圖2)。

圖2. 交換網(wǎng)固件虛擬化的主機(jī)域顯示為每個(gè)主機(jī)符合PCIe標(biāo)準(zhǔn)的單層交換網(wǎng)

在以下示例(圖3)中，我們給出了雙主機(jī)PCIe結(jié)構(gòu)引擎設(shè)置。此處，我們可以看到，結(jié)構(gòu)虛擬化允許每個(gè)主機(jī)看到一個(gè)透明PCIe拓?fù)?，其中包含一個(gè)上行端口、三個(gè)下行端口和三個(gè)連接到它們的端點(diǎn)，并且主機(jī)可以正確枚舉它們。圖3中的有趣之處是具有一個(gè)包含兩個(gè)虛擬功能的SR-IOV SSD，通過Microchip的PCIe高級結(jié)構(gòu)交換網(wǎng)，同一驅(qū)動(dòng)器的虛擬功能可以共享給不同的主機(jī)。

圖3. 雙主機(jī)PCIe^®結(jié)構(gòu)引擎

這種PAX結(jié)構(gòu)交換網(wǎng)解決方案還支持在各結(jié)構(gòu)之間直接跨域點(diǎn)對點(diǎn)傳輸，因此可減少根端口阻塞并進(jìn)一步緩解CPU性能瓶頸，如圖4所示。

圖4. 通過結(jié)構(gòu)路由通信，可減少根端口阻塞

性能優(yōu)化

在探索了NVMe驅(qū)動(dòng)器和GPU之間數(shù)據(jù)傳輸?shù)男阅軆?yōu)化過程中涉及的所有組件之后，現(xiàn)在可以結(jié)合使用這些組件來實(shí)現(xiàn)預(yù)期的結(jié)果。說明這一點(diǎn)的最佳方式是利用圖示演示各個(gè)步驟，圖5顯示了主機(jī)CPU及其根端口以及可實(shí)現(xiàn)最佳結(jié)果的各種配置。

如圖5左側(cè)所示，盡管使用的是高性能NVMe控制器，但由于根端口的開銷，PCI Gen 4 x 4(4.5 GB/s)的最大數(shù)據(jù)速率也限制為3.5 GB/s。不過，通過RAID(邏輯卷)同時(shí)聚合多個(gè)驅(qū)動(dòng)器(如右側(cè)所示)，SmartRAID控制器可為四個(gè)NVMe驅(qū)動(dòng)器各創(chuàng)建兩個(gè)RAID卷，并通過根端口創(chuàng)建傳統(tǒng)PCIe點(diǎn)對點(diǎn)路由。這會(huì)將數(shù)據(jù)速率提高到9.5 GB/s。

但是，利用跨域點(diǎn)對點(diǎn)傳輸(底部的圖)，可以通過結(jié)構(gòu)鏈路而不是根端口來路由通信，從而實(shí)現(xiàn)26 GB/s的速率，這是使用SmartROC 3200 RAID控制器可達(dá)到的最高速率。在最后一個(gè)場景中，交換網(wǎng)提供不受固件影響的直接數(shù)據(jù)路徑，并且仍然保持基于硬件的RAID保護(hù)和加密服務(wù)，同時(shí)充分利用GPUDirect存儲的全部潛能。

圖5. 實(shí)現(xiàn)26 GB/s的路徑

總結(jié)

高性能PCIe結(jié)構(gòu)交換網(wǎng)(例如Microchip的PAX)允許多主機(jī)共享支持單根I/O虛擬化(SR-IOV)的驅(qū)動(dòng)器，以及動(dòng)態(tài)劃分可在多個(gè)主機(jī)之間共享的GPU和NVMe SSD池。Microchip的PAX結(jié)構(gòu)交換網(wǎng)可以將端點(diǎn)資源動(dòng)態(tài)重新分配給需要這些資源的任何主機(jī)。

這種解決方案還使用了SmartROC 3200 RAID控制器系列支持的SmartPQI驅(qū)動(dòng)程序，因此無需自定義驅(qū)動(dòng)程序。Microchip的SmartROC 3200 RAID控制器是目前惟一能夠提供最高傳輸速率(即26 GB/s)的設(shè)備。它具有極低的延遲時(shí)間，可向主機(jī)提供最多16個(gè)PCIe Gen 4通道，并向后兼容PCIe Gen 2。與Microchip基于Flashtec®系列的NVMe SSD結(jié)合使用時(shí)，可在多主機(jī)系統(tǒng)中發(fā)揮PCIe和Magnum IO GPUDirect存儲的全部潛能?？傮w而言，上述所有特性使其能夠構(gòu)建一種強(qiáng)大的系統(tǒng)，該系統(tǒng)可以滿足AI、ML、DL以及其他高性能計(jì)算應(yīng)用的實(shí)時(shí)需求。